학원담당검사제는 일정 지역내의 수개의 중·고교에 대하여 전담검사를 지정, 유관기관이나 민간봉사차원의 학원폭력 예방 및 단속활동과의 유기적인 지원과 협조체제를 구축하여 체계적이고 내실있는 예방과 선도활동을 전개하기 위한 것이다.
학원담당검사제는 선도보호위원 및 교사선도위원, 학부모위원 등 구성원들과 정기 및 수시 간담회를 개최하여 학원폭력 정보수집 및 예방선도 활동방안을 모색하고, 탈선 초기의 학생 상대 개별 면담과 학부모 접촉을 통한 비행의 사전방지, 청소년범죄다발지역에 대한 합동순찰, 담당학교 학생들을 상대로 한 담당검사의 선도강연들을 실시하고 있다. 2005년 한해 동안 학교담당검사제 활동 실적은 합동순찰 6,846회, 간담회 1,701회, 우범학생 등 면담 8,684명, 선도강연 935회 등이다.